提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
(文图:赵筱尘 巫邓炎)
[责编:天天中]
阅读剩余全文()
视觉焦点
不愿单方面让步,日本拒绝对美国扩大农业市场准入
习近平会见奥地利总理
推荐阅读
天天彩票 APP疯狂采集个人信息 有的存储时间长达10年
2024-03-31
天天彩票 亲自去美国拍马屁的安倍 把国内舆论...
2023-10-01
天天彩票 米兰崩盘夜众生相:队长主动申请红牌 孔蒂看了直摇头
2024-05-14
天天彩票更具诚意和性价比,2019款领克01试驾
2024-03-23
天天彩票京津冀秋冬大气攻坚将严肃问责 不可气象条件搪塞
2024-01-12
天天彩票故宫斋宫佛像展,花开见佛
2023-12-12
天天彩票 姜子牙与姜尚是不是同一个人?
2023-09-09
天天彩票深圳一学校考生拔尖被疑系衡水中学高考移民 官方:资格合规
2024-03-15
天天彩票被曝主政时间与秦岭违建重叠
2024-03-03
天天彩票 央行将发行2019年版第五套人民币
2023-07-09
天天彩票泰禾再向世茂出售一项目股权,已累计回笼资金约37亿!
2024-01-04
天天彩票女副局长与群众座谈大耍官威:你哪小区的 记下来
2024-04-04
天天彩票新华每日电讯丨全球重工行业首个“灯塔工厂”的转型实践
2024-01-11
天天彩票请注意 500多岁的王阳明给你比了一个心
2024-05-09
天天彩票 迪士尼如何买断所有人的童年?
2023-11-20
天天彩票中超比埃拉戴帽张10破门 国安4-1一方7连胜破纪录
2024-01-12
天天彩票《创2》余远帆淘汰被粉丝扔鸡蛋:你为什么不坚持
2023-10-21
天天彩票小学副校长课间带头跳鬼步舞
2023-07-09
天天彩票衡阳书记:政府要给企业提供母亲式服务
2024-03-20
天天彩票3分钟带你漫游苏州水乡古镇
2024-01-24
天天彩票 20世纪精彩的历史瞬间
2023-08-18
天天彩票男子睡觉时误食苹果AirPods,排出后仍可正常使用
2023-11-11
加载更多![](/t2/images/1.gif)
天天彩票地图